IPBES Danmark blev oprettet i efteråret 2016 som en del af det internationale IPBES-netværk i samarbejde Københavns Universitet, Århus Universitet, Syddansk Universitet samt Miljøministeriet. Det danske koordinationskontor er en del af det internationale IPBES-netværk, som består af ca. 140 nationer, herunder Danmark. Formålet med IPBES er at styrke sammenhængen mellem forskning og politik i relation til biodiversitet og økosystemydelser.